当地时间4月13日，菲律宾交通部(DOTr)宣布，首都区四条铁路系统的确诊感染人数目前已经上升至787人。
菲交通部此前表示：“为确保通勤者和铁路工作者的安全，交通部长已经下令根据风险级别逐步对所有员工进行大规模检测活动。”
截至目前，轻轨一号线的1185名员工中，794人已经接受新冠检测，其中120人确诊感染新冠病毒。轻轨二号线的1944名员工中，1870人已经接受新冠检测，其中251人确诊感染新冠病毒。大岷电车三号线的3284名员工中，936人已经接受新冠检测，其中208人确诊感染新冠病毒。菲国铁的1829名员工中，1252人已经接受新冠检测，其中208人确诊感染新冠病毒。
菲交通部表示，除了确诊工作人员外，所有仍在等待检测结果、出现新冠病毒症状以及与确诊患者有过密切接触的工作人员目前都处于隔离状态。
首都区三条铁路系统于4月5日重新恢复运营，但轻轨一号线将从原本的24列列车缩减到17列，轻轨二号线将维持最低限度的5列列车，大岷电车三号线将从原本20列缩减到10至12列。菲国铁于4月12日开始恢复运营，但只派出10只12列的列车。
受影响的旅客可以在乙沙大道(EDSA)乘坐环形公交线路，或者乘坐9号线、10号线以及17号线巴士前往目的地。